Batman Beyond นำเสนอรูปแบบใหม่ที่ไม่เหมือนใครในตำนานแบทแมนที่คุ้นเคย และในขณะที่ DC Animated Universe ทำผลงานได้อย่างน่าทึ่งในการสร้างความต่อเนื่องของแอนิเมชั่นที่ครอบคลุม Batman Beyond ดำเนินเรื่องนั้นไปสู่อนาคตและแสดงให้เห็นตอนจบของตัวละครในการ์ตูนที่แทบจะไม่สามารถปักหมุดได้ ในบางกรณี ตัวละครได้รับตอนจบที่มีความสุขที่พวกเขาสมควรได้รับเสมอ แต่บางทีโศกนาฏกรรมครั้งใหญ่ที่สุดของ DCAU ก็คือโรบินเพื่อนสนิทของแบทแมนและชะตากรรมที่ตกอยู่กับเขาด้วยน้ำมือของโจ๊กเกอร์
ในไทม์ไลน์ปัจจุบันของ แบทแมน: ซีรีย์อนิเมชั่น, บรูซค้นพบเพื่อนกำพร้าดิ๊ก เกรย์สันและพาเขาไปอยู่ใต้ปีกของเขา คู่หูที่มีพลังของแบทแมนและโรบินจะต่อสู้กับอาชญากรรมนับครั้งไม่ถ้วน แต่ในที่สุด ความแตกแยกเกิดขึ้นจากการเป็นหุ้นส่วนของพวกเขา และดิ๊กก็ย้ายไปที่บลือดาเวนที่อยู่ใกล้เคียงเพื่อเป็นไนท์วิง เด็กกำพร้าคนใหม่ Tim Drake กลายเป็นโรบินใหม่และ Batman Beyond: การกลับมาของโจ๊กเกอร์ ในที่สุดก็จะเปิดเผยชะตากรรมของเขาใน DCAU
เรื่องราวของ Drake ใน DCAU เป็นการผสมผสานระหว่างตัวละครจากการ์ตูนและของ Jason Todd ซึ่งเป็นที่รู้จักกันดีในนาม Robin ที่เสียชีวิตด้วยน้ำมือของ Joker ในการ์ตูน ทอดด์กลับมาหลอกหลอนแบทแมนอีกครั้งในฐานะหมวกแดง ซึ่งเป็นเครื่องเตือนใจถึงความบาปในอดีต DCAU สามารถตีจังหวะเดียวกันได้หลายจังหวะโดยใช้ Drake ในขณะที่ใส่สปินที่เป็นเอกลักษณ์ของตัวเองลงไป
ใน การกลับมาของโจ๊กเกอร์ แบทแมนคนใหม่ของปี 2040 ได้เรียนรู้ว่าก่อนที่บรูซ เวย์นจะเกษียณและแยกตัวออกจากคนรอบข้างมากขึ้น เขาและทิม เดรกก็พบกับโจ๊กเกอร์เป็นครั้งสุดท้าย หลังจากที่ทิมหายตัวไปเป็นเวลา 3 สัปดาห์ แบทแมนพบเขาที่โรงพยาบาล Arkham Asylum ที่ถูกทิ้งร้าง ซึ่งปรากฏว่าโจ๊กเกอร์ทรมานเขาเพื่อหาข้อมูลและล้างสมองเขาให้กลายเป็นตัวตลก วัยรุ่นที่ถูกรบกวนอย่างสุดซึ้งหันมาหาโจ๊กเกอร์และดูเหมือนจะฆ่าเขาทันทีและตลอดไป ทำให้ทิมบอบช้ำไปตลอดกาลและบังคับให้เขาต้องเกษียณ
แต่เรื่องราวของทิมยังไม่จบ เมื่อดูเหมือนว่าโจ๊กเกอร์จะรอดจากความตายที่เห็นได้ชัดของเขา การกลับมาของโจ๊กเกอร์ เผยให้เห็นเจ้าชายแห่งอาชญากรรมและทิมเดรกเป็นหนึ่งเดียวกัน ในขณะที่ทิมเป็นเชลยของโจ๊กเกอร์ คนร้ายได้เข้ารหัส DNA ของเขาด้วยเทคโนโลยีทดลองที่สามารถแทนที่ร่างกายและจิตใจของทิมด้วยคุณลักษณะทางร่างกายและจิตใจของตัวเอง หมายความว่าโจ๊กเกอร์ไม่เพียงแต่เอาชีวิตรอดจากความตายของเขาเท่านั้น แต่ยังเพิ่มการดูถูกอาการบาดเจ็บทางจิตของแบทแมนด้วย
ด้วยความต่อเนื่องของ DCAU ที่มักจะทำให้เกิดเหตุการณ์จากการ์ตูน ทำให้ Drake กลายเป็นโจ๊กเกอร์เป็นหนึ่งในวิธีที่สร้างสรรค์และซื่อสัตย์ที่สุดไปพร้อม ๆ กันในการปรับตัวส่วนสำคัญของ Batman mythos ด้วยความทุกข์ทรมานจากการถูกจำกัดสถานะในฐานะ 'การ์ตูนสำหรับเด็ก' ภาพยนตร์แอนิเมชั่นเรื่องนี้จึงสามารถถ่ายทอดเรื่องราวที่มืดมนและน่าวิตกได้ แบทแมนเป็นบุคคลที่น่าสลดใจ และสิ่งที่เข้ากันได้ก็คือการเปลี่ยนผู้ที่อยู่รอบตัวเขาให้กลายเป็นอาหารสัตว์สำหรับโศกนาฏกรรม